Η κωνοειδής εκτομή θεωρείται «χειρουργείο μιας ημέρας» και πραγματοποιείται σε εξειδικευμένα νοσοκομεία. Διαρκεί περίπου 15-20 λεπτά και μετά το τέλος της δεν απαιτείται διανυκτέρευση στο νοσοκομείο.
Θα χρειαστεί να βγάλετε τα ρούχα σας, να φορέσετε την ειδική ρόμπα και να ουρήσετε πριν την επέμβαση. Θα ξαπλώσετε σε θέση λιθοτομίας. Θα λάβετε αναισθησία (γενική, περιοχική ή τοπική). Ακολουθεί καθαρισμός του κόλπου και του τραχήλου με αντισηπτικό διάλυμα. Κατόπιν τοποθετείται κολποδιαστολέας που απάγει τα τοιχώματα του κόλπου προκειμένου να φανεί ο τράχηλος της μήτρας. Στη συνέχεια υπό μεγέθυνση με το κολποσκόπιο, διενεργείται η κωνοειδής βιοψία. Το ιστοτεμάχιο που λαμβάνεται αποστέλλεται προς ιστολογική εξέταση.
Αμέσως μετά την επέμβαση, θα μεταφερθείτε στο χώρο ανάνηψης του χειρουργείου, όπου θα παραμείνετε για παρακολούθηση για λίγη ώρα και στη συνέχεια θα επιστρέψετε σπίτι. Καλό είναι να μην οδηγήσετε εσείς. Οι περισσότερες γυναίκες αναρρώνουν πλήρως σε 1 εβδομάδα.